Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CtshP49935 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtshP49935 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtshP49935 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CtshP49935 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CtshP49935 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtshP49935 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtshP49935 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtshP49935 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtshP49935 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CtshP49935 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CtshP49935 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtshP49935 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CtshP49935 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtshP49935 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtshP49935 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CtshP49935 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtshP49935 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CtshP49935 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtshP49935 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtshP49935 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtshP49935 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtshP49935 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CtshP49935 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CtshP49935 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtshP49935 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtshP49935 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtshP49935 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtshP49935 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CtshP49935 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CtshP49935 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CtshP49935 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtshP49935 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtshP49935 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtshP49935 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CtshP49935 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CtshP49935 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtshP49935 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtshP49935 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtshP49935 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtshP49935 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CtshP49935 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CtshP49935 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms