Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrprbP47758 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SrprbP47758 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SrprbP47758 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SrprbP47758 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.8 ms