Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brcc3P46737 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brcc3P46737 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brcc3P46737 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms