Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf4P43488 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf4P43488 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf4P43488 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf4P43488 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tnfsf4P43488 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf4P43488 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf4P43488 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms