Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdc2P43407 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdc2P43407 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdc2P43407 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms