Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Foxk1P42128 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Foxk1P42128 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Foxk1P42128 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms