Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Col18a1P39061 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Col18a1P39061 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Col18a1P39061 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col18a1P39061 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col18a1P39061 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col18a1P39061 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Col18a1P39061 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Col18a1P39061 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col18a1P39061 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col18a1P39061 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms