Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddit3P35639 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ddit3P35639 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ddit3P35639 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms