Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin1P35438 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Grin1P35438 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grin1P35438 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin1P35438 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grin1P35438 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms