Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab23P35288 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab23P35288 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab23P35288 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab23P35288 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms