Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ifnar1P33896 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifnar1P33896 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms