Protein–RNA interactions for Protein: P32972

Tnfsf8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf8P32972 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tnfsf8P32972 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf8P32972 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms