Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd28P31041 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd28P31041 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms