Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnnd1P30999 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ctnnd1P30999 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ctnnd1P30999 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms