Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OatP29758 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OatP29758 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OatP29758 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OatP29758 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OatP29758 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OatP29758 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OatP29758 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OatP29758 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OatP29758 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OatP29758 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OatP29758 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OatP29758 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OatP29758 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OatP29758 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OatP29758 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OatP29758 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OatP29758 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OatP29758 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
OatP29758 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OatP29758 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OatP29758 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OatP29758 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms