Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vcam1P29533 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vcam1P29533 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms