Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dusp1P28563 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms