Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxd10P28359 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms