Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lef1P27782 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lef1P27782 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms