Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb7P26011 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itgb7P26011 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms