Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Aldh1a1P24549 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Aldh1a1P24549 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms