Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd12P23812 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms