Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfyaP23708 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfyaP23708 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NfyaP23708 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms