Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja1P23242 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gja1P23242 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gja1P23242 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms