Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx3P23198 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms