Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk1P22518 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clk1P22518 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clk1P22518 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms