Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb1aP21447 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb1aP21447 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Abcb1aP21447 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms