Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ms4a2P20490 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms