Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fcer1aP20489 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fcer1aP20489 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms