Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rag1P15919 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rag1P15919 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms