Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrphP15331 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrphP15331 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrphP15331 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrphP15331 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrphP15331 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrphP15331 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrphP15331 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrphP15331 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrphP15331 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrphP15331 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrphP15331 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrphP15331 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrphP15331 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrphP15331 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PrphP15331 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrphP15331 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrphP15331 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrphP15331 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrphP15331 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrphP15331 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrphP15331 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrphP15331 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrphP15331 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrphP15331 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms