Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lmnb1P14733 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmnb1P14733 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmnb1P14733 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmnb1P14733 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms