Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb1P13372 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms