Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OtcP11725 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OtcP11725 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OtcP11725 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OtcP11725 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OtcP11725 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OtcP11725 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OtcP11725 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OtcP11725 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OtcP11725 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OtcP11725 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OtcP11725 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OtcP11725 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OtcP11725 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
OtcP11725 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
OtcP11725 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
OtcP11725 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
OtcP11725 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OtcP11725 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OtcP11725 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OtcP11725 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
OtcP11725 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
OtcP11725 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms