Protein–RNA interactions for Protein: P11672

Lcn2, Neutrophil gelatinase-associated lipocalin, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn2P11672 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn2P11672 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn2P11672 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn2P11672 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lcn2P11672 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lcn2P11672 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lcn2P11672 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lcn2P11672 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms