Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Myod1P10085 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Myod1P10085 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms