Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Amd1P0DMN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Amd1P0DMN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Amd1P0DMN7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms