Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
P06344 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06344 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06344 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P06344 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06344 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06344 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06344 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06344 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06344 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P06344 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06344 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
P06344 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06344 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06344 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06344 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P06344 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P06344 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06344 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P06344 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06344 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P06344 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P06344 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P06344 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P06344 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P06344 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P06344 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P06344 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms