Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06321 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P06321 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P06321 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06321 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06321 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P06321 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P06321 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P06321 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06321 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06321 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06321 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P06321 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms