Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cd3dP04235 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd3dP04235 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd3dP04235 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms