Protein–RNA interactions for Protein: P01812

Ig heavy chain V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01812 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01812 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01812 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01812 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01812 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01812 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01812 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01812 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01812 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01812 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01812 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01812 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01812 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01812 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms