Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01747 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01747 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01747 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01747 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01747 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01747 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01747 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01747 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01747 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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