Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mtatp6P00848 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mtatp6P00848 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mtatp6P00848 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms