Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lancl1O89112 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lancl1O89112 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms