Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn3O88990 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actn3O88990 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms