Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tom1O88746 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tom1O88746 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tom1O88746 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tom1O88746 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tom1O88746 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tom1O88746 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tom1O88746 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tom1O88746 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tom1O88746 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tom1O88746 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Tom1O88746 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms