Protein–RNA interactions for Protein: O88728

Ifitm5, Interferon-induced transmembrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm5O88728 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifitm5O88728 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ifitm5O88728 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ifitm5O88728 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm5O88728 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ifitm5O88728 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms