Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hcn2O88703 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hcn2O88703 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms