Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Sema3fO88632 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema3fO88632 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3fO88632 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms