Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lmx1bO88609 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmx1bO88609 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms